La Macro Línea de Investigación sobre la cual se rige el CIAB es la BIOTECNOLOGÍA DE LA CONSERVACIÓN. En este sentido, el CIAB opera bajo tres Líneas de Investigación principales, y una cuarta que surge de la necesidad de responder a la variabilidad del entorno y figura como una línea transversal y complementaria a las tres líneas principales:

La Contribución Social y Ambiental de las líneas de investigación son:

Conservación y Uso de los Recursos Fitogenéticos:

• Aumento de la base genética y mejoramiento vegetal principalmente en términos de productividad y calidad con fines de sostenimiento de la seguridad alimentaria y conservación de la biodiversidad colombiana.
• Obtención de registro de obtentor de variedades vegetales.
• Banco de germoplasma in vivo e in vitro.
• Gestión de biofábrica.

Relación Agua, Suelo, Planta, Atmosfera y Sociedad:

• Identificación y evaluación de factores asociados a la degradación de los recursos naturales.
• Desarrollo de estrategias para la conservación de los recursos fitogenéticos, suelo y agua y de los servicios ecosistémicos que éstos generan.
• Implementación de modelos productivos sostenibles y sustentables.
• Desarrollo de equipos y software para agricultura de precisión tanto en el contexto rural como urbano.

Biotecnología Agrícola y Ambiental:

• Exploración de recursos biotecnológicos con miras al desarrollo de biocontroladores, biofertilizantes y/o mejoradores de las condiciones ambientales de sistemas degradados.
• Proyección de tecnología encaminada hacia el uso de energías renovable.